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특허출원이 이루어지면 먼저 출원이 방식적으로 완비되었는지 여부를 심사하게 되며 출원에 흠결사항이 없거나 보정에 의해 흠결이 치유된 경우에는 출원번호가 발급된다. 특허출원번호는 권리식별번호 2자리 숫자, 출원년도를 표시하는 4자리 숫자 및 일련번호로 구성된다.

특허출원번호가 발행된 경우에는 출원된 발명품과 관련된 제품에 특허출원번호를 표기할 수 있다.

특허출원에 대해서는 출원인 또는 제3자가 심사청구를 한 경우에 한하여 특허요건을 갖추었는지를 심사하게 된다. 심사청구는 특허출원일로부터 5년내에 할 수 있으며, 이 기간내에 심사청구를 하지 않으면 당해 출원은 취하된 것으로 간주된다.

기술분야별로 차이가 있으나 2002년 현재 출원일로부터 약 25개월 가량 소요된다.
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우선심사- 타출원보다 먼저 특허받기

특허출원은 심사청구순서에 따라 심사됨이 원칙이나 일정한 경우 심사청구순서에 상관 없이 먼저 심사가 진행되기도 한다. 따라서 빠르면 출원일로부터 3개월내에 특허증이 발행될 수 도 있다. 우선 심사의 대상은 특허, 의장출원으로(상표는 없음) 심사청구가 된 것 중 다음에 해당하는 것이며 별도의 수수료와 함께 신청하여야 한다.

* 출원공개 후 제3자가 업으로서 출원된 발명을 무단 실시하는 경우
* 방위산업분야 출원
* 공해방지에 유용한 출원
* 수출촉진에 직접 관련된 출원
* 국가 또는 지방자치단체의 직무에 관한 출원
* 벤처기업 확인을 받은 기업의 출원
* 산업기반기술개발사업 등 국가 신기술개발 지원사업의 결과물에 관한 출원
* 국가품질인증사업 결과물에 관한 출원
* 해외출원으로 외국특허청에 절차가 진행 중인 출원
* 자기실시 또는 자기실시 준비 중인 출원
* 부품.소재 기술개발전문기업의 확인을 받은 기업
* 전자거래와 직접 관련된 특허출원

신청이유	증빙서류
제3자실시 출원	제3자가 실시하고 있음을 입증하는 서류 (사진,카탈로그 등)
방위산업분야의 출원	제4조 제2호 가목에서 규정하고 있는 출원내용에 해당함을 입증하는 서류
수출촉진에 직접 관련된 출원	다음의 1에 해당하는 서류 1. 수출실적 입증서류 2. 신용장내도 입증서류 3. 특허권ㆍ실용신안권 또는 의장권이 필요하다는 수출품 구매자로부터의 요청이있음을 증명하는 서류 4. 수출계약 입증서류 5. 기타 수출촉진에 직접 관련이 있음을 입증하는 서류
벤처기업의 출원	벤처기업육성에관한특별조치법 제25조의 규정에 의한 벤처기업 확인서
국가의 신기술개발 지원사업의 결과물에 관한 출원	제4조 제2호 바목에서 규정하고 있는 출원내용에 해당함을 입증하는 서류
국가의 품질인증 사업의 결과물에 관한 출원	제4조 제2호 사목에서 규정하고 있는 출원내용에 해당함을 입증하는 서류
조약에 의한 우선권 주장의 기초가 되는 출원	우선권주장의 기초가 되는 출원임을 입증하는 서류 (외국 특허청에 제출한 출원서 사본 등)
자기실시 출원	자기실시를 입증하는 서류 (사진, 카탈로그, 매출실적을 증명하는 서류 등)
자기실시 준비중인 출원	다음의 1에 해당하는 서류 1. 창업투자회사ㆍ신기술사업투자조합 등으로부터의 투자실적서 2. 은행 등으로부터의 대출실적서 3. 출원기술의 실시에 관한 계약서 4. 기타 자기실시 준비중임을 입증하는 서류
부품·소재 기술개발 전문기업의 출원	부품·소재전문기업등의육성에관한특별조치 법시행규칙 제6조의 규정에 의한 부품·소재 기술 개발전문기업확인서

특허출원일로부터 1년 6개월이 경과한 때 또는 출원인의 조기공개 신청이 있는 때에 특허출원의 내용을 공보(공개공보)에 게재하게 되는데, 이에 의해 동일한 발명에 대한 중복연구, 중복투자가 방지된다. 특허출원 공개공보는 인터넷으로도 발행되고 있다. 출원공개된 발명을 무단으로 실시하는 자에 대해 출원인은 경고 및 보상금청구권을 행사할 수 있다.

심사청구가 된 출원에 대해서는 심사청구순서에 따라 실체심사가 진행된다. 심사관은 특허요건에 부합 되지 않은 출원에 대해서는 기술문헌(대부분은 특허문헌)과 함께 특허 받을 수 없는 이유를 서면으로 통보하여 출원인에게 의견제출의 기회를 부여한다. 이때 출원인은 심사관이 제시한 자료와 당해 출원발명을 대비 판단하여 자신의 의견을 주장할 수 있으며, 경우에 따라서는 보정서를 제출할 수 있다. 특허를 받기 위해서는 다음과 같은 발명에 해당하지 않아야 한다.

* 특허출원 전에 국내에서 불특정다수인이 알고 있거나 알 수 있는 상태에 놓여 있는 발명
* 특허출원 전에 국내에서 불특정다수인이 알 수 있는 상태에서 실시된 발명
* 특허출원 전에 국내외에서 반포된 간행물에 기재된 발명
* 특허출원 전에 국내외에서 대통령령이 정하는 전기통신회선(예, 인터넷)을 통하여 공중이 이용 가능하게 된 발명
* 위 각 항목의 발명으로부터 당업자라면 별다른 노력 없이 용이하게 할 수 있는 발명
* 타인이 먼저 출원한 발명
* 당업자가 용이하게 실시할 수 있을 정도로 발명의 목적, 구성, 효과가 명세서에 기재되어 있지 않은 경우.
* 특허청구범위가 간결, 명확하게 기재되어 있지 않거나, 발명의 상세한 설명에 의해 뒷 받침 되지 않는 경우 또는 발명의 필수 구성요소만으로 기재되지 않은 경우 등.